EXON-INTRON pattern analysis
组织者
演讲者
时间
2024年10月14日 21:00 至 21:30
地点
Online
摘要
Provide a new approach to predict the EXON/INTRON position pattern.First, we use NV to training a NN for hs37 dataset. Then we select an existing gene’s EXON and INTRON segment construct the full fasta sequence as the test dataset.The new approach start with a general pattern match according to the rule:每个内含子的开始两个碱基都是GT,最后两个是AG,Then generate all potential possible position patterns.By predicting each segment EXON/INTRON using NN, we can eliminate invalid patterns.Finally further combining with biology info to eliminate more invalid patterns.
演讲者介绍
北京雁栖湖应用数学研究院研究员
西安交通大学, 计算数学专业, 本科，硕士。
美国UIC大学，计算机科学，博士, 研究方向：非线性滤波控制，导师：Stephen S.-T Yau 丘成栋
毕业后主要在美国的无线通信领域工作。他曾在朗讯、阿尔卡特朗讯、诺基亚等公司担任高级工程师。
2024 年 1 月加入北京数学科学与应用研究院 （BIMSA），目前从事神经网络、人工智能、大数据、机器学习和生物数学方面的研究。
西安交通大学, 计算数学专业, 本科，硕士。
美国UIC大学，计算机科学，博士, 研究方向：非线性滤波控制，导师：Stephen S.-T Yau 丘成栋
毕业后主要在美国的无线通信领域工作。他曾在朗讯、阿尔卡特朗讯、诺基亚等公司担任高级工程师。
2024 年 1 月加入北京数学科学与应用研究院 （BIMSA），目前从事神经网络、人工智能、大数据、机器学习和生物数学方面的研究。